Im Rahmen des vom Bundesministerium für Bildung und Forschung geförderten "Qualitätspakt Lehre" kooperiert die Europa-Universität Flensburg zusammen mit der Fachhochschule Flensburg und der Fachhochschule Kiel in dem gemeinsamen Projekt "Mehr StudienQualität durch Synergie - Lehrentwicklung im Verbund von Fachhochschule und Universität (MeQS)".